| Visitatio sepulchri (Schola Georgiana, Schola Gregoriana) Supraphon 1992, 111562-2931 |
| Office des morts — Messe de la Toussaint (SGP & Choeur Grégorien de Paris) Jade 1993, CGPFF 9305
|
| Bohemorum sancti Čeští světci v nebeském Jeruzalémě Supraphon 1994, SU 0003-2231 ocenění Choc du Monde de la Musique (říjen 1996), 10 de Repertoire (prosinec 1996)
|
| Rosa mystica Mariánská úcta ve středověkých Čechách Supraphon 1995, SU 0194-2231
ocenění Choc du Monde de la Musique (říjen 1996), Cena „Zlatá Harmonie“ za nejlepší českou nahrávku roku 1995
|
| In Pragensi Ecclesia Vánoce v pražské katedrále v době Karla IV. Supraphon 1996, SU 3191-2231 ocenění Choc du Monde de la Musique (červenec 1997)
|
| Anno Domini 997 Tisíc let úcty ke svatému Vojtěchu Supraphon 1997, SU 3288-2231 |
| Liturgický rok Supraphon 1997, SU 3271-2231 ocenění Tip Harmonie (leden 1998) |
| Antica e moderna Gregoriánský chorál ke svátku Posvěcení chrámu, Petr Eben: Suita liturgica (společně s P. Ebenem) Supraphon 1998, SU 3373-2231 ocenění Choc du Monde de la Musique (květen 1999)
|
| Codex Franus Repertorium českých utrakvistů dle významného pramene z počátku 16. století Supraphon 1999, SU 3407-2231 ocenění Choc du Monde de la Musique (říjen 1999), Cena Harmonie za nejlepší nahrávku roku 1999 v kategorii středověk a renesance
|
| Adoratio crucis Repertoár Uctívání kříže z liturgie Svatého týdne (SGP & Český chlapecký sbor Boni pueri) Supraphon 2000, SU 3448-2231 |
| Ach, homo fragilis Duchovní středověká lyrika Supraphon 2002, SU 3623-2231 ocenění Choc du Monde de la Musique (březen 2003)
|
| Adam Václav Michna Missa III., Vesperae BMV, Litaniae (SGP & Societas Incognitorum)
Rosa 2004, RD 1161 |
| Maiestas Dei Středověká polyfonie v díle Petra W. de Grudencz Supraphon 2005, SU 3807-2 ocenění Choc du Monde de la Musique (září 2005)
|
| Vepres pour Sainte Marie Madeleine
gregoriánský chorál a soudobá hudba
(SGP & Arsys Bourgogne)
Universal Music 2006, 4769939 |
| Salve Mater, Salve Jesu
(SGP & Capilla Flamenca & B. M. Willi)
Et'Cetera 2007, KTC 1346 |
| Blízké hlasy zdáli hudební dialog dvou světů (společně se sborem
japonských buddhistických mnichů Gyosan-ryu Tendai Shomyo) SONY BMG 2007, 82876873042 |
| Dialogues
dialog lidského hlasu a violoncella od gregoriánského chorálu a rané polyfonie až po soudobou hudbu
(SGP & Jiří Bárta) Supraphon 2010, SU 4009-2 |
| Adventus Domini
adventní mše Rorate v českých kancionálech 15.-16. století, rorátní zpěvy
Supraphon 2011, SU 4071-2 |
| Carolus IV.
hudba doby Karla IV.
(SGP & Hana Blažíková, Jakub Kydlíček) Supraphon/ArteVisio 2015, SU 4193-2 |
| Septem dies
hudba na pražské univerzitě 1360–1460
(SGP & Corina Marti) Supraphon 2021, SU 4282-2 |